Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNFT2Q96EX2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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