Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP3Q96DZ5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms