Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms