Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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PTPRUQ92729 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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PTPRUQ92729 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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PTPRUQ92729 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
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