Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms