Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms