Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL3Q8IVW4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL3Q8IVW4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms