Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms