Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms