Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms