Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RTL6Q6ICC9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RTL6Q6ICC9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RTL6Q6ICC9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RTL6Q6ICC9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RTL6Q6ICC9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RTL6Q6ICC9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RTL6Q6ICC9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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