Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms