Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms