Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms