Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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