Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms