Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms