Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms