Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms