Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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GEN1Q17RS7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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