Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATP6V1FQ16864 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms