Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms