Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ZNF239Q16600 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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