Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms