Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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