Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PTPRRQ15256 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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PTPRRQ15256 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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PTPRRQ15256 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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PTPRRQ15256 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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PTPRRQ15256 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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PTPRRQ15256 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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