Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PDCD1Q15116 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDCD1Q15116 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDCD1Q15116 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDCD1Q15116 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDCD1Q15116 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDCD1Q15116 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDCD1Q15116 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDCD1Q15116 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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