Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms