Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms