Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL19A1Q14993 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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COL19A1Q14993 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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COL19A1Q14993 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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COL19A1Q14993 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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COL19A1Q14993 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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COL19A1Q14993 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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COL19A1Q14993 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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COL19A1Q14993 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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COL19A1Q14993 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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COL19A1Q14993 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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COL19A1Q14993 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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