Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms