Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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