Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms