Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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