Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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