Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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