Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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NFX1Q12986 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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NFX1Q12986 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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NFX1Q12986 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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