Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms