Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms