Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms