Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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