Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
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