Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms