Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms