Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLEQ07864 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLEQ07864 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
POLEQ07864 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms