Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms