Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms