Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
XPCQ01831 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
XPCQ01831 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
XPCQ01831 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XPCQ01831 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms