Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms