Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms